Salve, galera!
Muita gente escreve esta expressão da segunda maneira (com acento), mas nada justifica a crase, pois “valer” é um verbo transitivo direto e “a pena” é um objeto direto, em que o “a” é só um artigo definido concordando em gênero e número com o substantivo feminino singular “pena”. A expressão “valer a pena” significa “valer o sacrifício”. Logo, a única forma adequada é sem acento: “Sei que vale a pena estudar mais” (Sei que estudar mais vale a pena, vale o sacrifício).
Molezinha! 🙂